中国科学院数学与系统科学研究院创建于1998年12月,是由中科院数学研究所(建于1952年)、应用数学研究所(建于1979年)、系统科学研究所(建于1979年)及计算数学与科学工程计算研究所(建于1995年)等四个研究所整合而成。全院现有职工337人,科研人员231人,其中研究员108人,正研级高工3人,副研究员46人,高级工程师5人。研究院另有博士后52人。
数学与系统科学研究院科研队伍实力雄厚,荟萃了我国许多著名的数学家和系统科学家,目前已形成了一支素质精良、具有很强竞争力的科研人才群体。研究院现有中国科学院院士16人,中国工程院院士2人,中科院“百人计划”入选者22人,国家杰出青年基金获得者A类35人,B类18人,C类1人。